为加强对粮食流通专项资金使用情况的监督检查和资金绩效情况的评估，不断提高粮食流通专项资金的使用效益，贵州省粮食局采取县级自查、省和市州分别抽查的方式于2017年6月1日至10月31日对2016年度粮食流通专项资金以及中央财政补助资金开展了专项检查工作。
2016年度省粮食局实施的各类财政专项资金项目共计135个，资金总计8，018万元，其中：粮食流通专项资金项目62个，资金共计3，000万元;“粮安工程”粮库智能化升级改造专项资金项目69个，资金共计4，078万元;中央预算内投资项目4个，资金共计940万元。以上资金项目，县级粮食行政管理部门进行了全面自查，市(州)级粮食行政管理部门抽查项目88个，检查资金3，979万元，省局抽查项目8个，检查资金2，718万元，省、市级抽查面超过70%。综合各级粮食行政管理部门的检查情况来看，贵州省实施的2016年度各类财政专项资金到位及时，使用合规，专项资金的投入对促进贵州省粮食流通基础设施建设，加快粮食产业发展，搞好脱贫攻坚，增强粮食宏观调控能力，确保省内粮食安全等方面发挥了重要作用。但检查中也发现诸如：市县配套资金到位率及到位时效不理想、项目启动不及时或进度缓慢、上级主管部门审核把关不严等问题。对发现问题的部门和单位，省粮食局及时下达了整改通知或予以了通报批评，要求及时进行整改，按照项目实施要求，加快推进项目进度，确保项目按期完成，切实发挥财政资金使用效益。