苏格兰鲑鱼年出口额大约5亿美元，但英国公投决定脱欧后，一旦脱欧手续完成，苏格兰鲑鱼出口商或将主要出口地区设定的进口贸易壁垒。养殖鲑鱼占苏格兰食品出口贸易中的比重最大，曾不受任何贸易壁垒制约。
苏格兰出口商表示，英国脱欧后，较为乐观的预期是英国脱离欧洲区，但保留欧洲经济区（EEA）成员身份，如果继续保留EEA成员身份，那么英国必须接受人员的自由流动，并共同承担欧盟的预算。苏格兰鲑鱼对欧洲的出口关税曾为2%，如果英国不再保留EEA成员身份，预计欧洲今后势必会大幅提高苏格兰鲑鱼的进口关税，目前欧洲对非EEA成员国的关税为8%。
苏格兰鲑鱼对欧洲外国家和地区的出口也面临困境，应部分进口国要求，苏格兰出口商不得不申请出口许可证，以及英国必须重新加入WTO。
苏格兰鲑鱼产业或将陷入窘境，70%的养殖区域获得挪威方面的投资，在脱欧前，苏格兰与挪威之间的合作得益于双边的减免关税政策，英国脱欧后，会失去投资者的兴趣，也会降低市场竞争力。苏格兰养殖协会表示，如果英国选择独立贸易经济模式，只能依附WTO规则和关税政策，这或将彻底危害苏格兰养殖业发展。