全国青年运动会开赛以来，福建省各级食品药品监管部门紧紧围绕青运会举办期间运动员驻地和赛场不发生一起食物中毒事件、不发生一起食源性和药源性兴奋剂事件的“两个零”目标，采取一系列措施，保障青运会食品药品安全。
一是抓好源头把控。按标准规定和程序要求遴选52家种植、养殖基地（企业）。
二是加强食材监管。根据不同阶段的保障要求，分5批派出督导组93人次，对各赛区遴选基地（企业），从农兽药使用登记、饲料管理、监管记录等环节进行检查督导。
三是坚持批批检测。在青运村总仓、运动员接待酒店周转仓设置了食材检测小组，食材进仓前进行批批检测，截至目前共检测食材1604批次，合格1578批次，合格率为98.37%。
四是实行食材专车押运。对运动员食材实行运输前后的铅封、解封，运输过程全程押运，保障食品运输过程安全顺畅。
五是驻点全程监管。对合格入仓食材从原料把关、粗加工、洗消、烹调等全链条由监督人员进行现场全程监管。同时，安排力量对食品药品市场开展巡回检查。从2015年4月20日首场测试赛至今，组织培训各类监管骨干300余人次，培训从业人员和服务员2300多人次，出动监管人员6578人次，驻点监厨842人次，开展食品药品安全保障和应急处置演练16场次。