近年来，余干渔业在“保护生态，发展养殖，压缩捕捞，主攻加工，搞活流通”方针政策指导下，坚持市场化发展方向，优化渔业产业结构，拓宽渔业发展空间，加强科技创新和推广应用，发展非常迅猛。
该县以“一条鱼一个产业”的发展战略，推进水产品牌发展，涌现出了一大批水产产业化龙头企业、渔业合作社和水产知名品牌，有效地提升了水产品质量安全水平。目前，全县已创建部级水产生态健康养殖示范场（基地）8个，养殖面积20余万亩；获得绿色食品、无公害水产品认证的水产养殖龙头企业6家，9个水产品及初级水产加工品获得无公害食品认证。其中，余干县瑞洪镇的“鄱浪”牌乌鱼，“益人”牌河蟹与鳙鱼，鹭鸶港的“兴鄱”牌鳜鱼等特色水产品均获得了绿色或无公害水产品质量认证；成立专业渔业合作社10家，发展社员近千户。
坚持把加工与流通作为主攻方向，水产品市场不断开拓，水产品加工率不断提升，加工产品的数量不断增加、质量不断提高，渔业外向度不断拓宽。目前，全县有江西省全阜水产食品公司和江南水产品加工有限公司两家渔业加工企业，年加工各类鱼类过万吨，产值均超千万。
以送科技进村入户为平台，以乌鱼、黄鳝、鳜鱼、草鱼、泥鳅为主导品种，重点搞好池塘高效健康养殖技术，网箱健康养鳝实用技术、草鱼健康养殖技术、水质调控技术，配合饲料养殖技术和鱼病防控技术六项技术推广。今年以来，共开展技术推广普及培训15次，培训渔民1300余人，发放技术资料2000余份，辐射带动周边县乡5000余户水产养殖。
该县不断规范渔业行政执法管理，加大渔业执法的力度。今年在全县范围内开展水产养殖专项执法和渔业养殖船舶安全检测行动5次，出动执法人员26人次，发放渔业法规宣传材料1800份。对全县水产养殖基地，水产原良种场及集约化水产养殖企业进行执法检查3次，重点检查了养殖证持证、苗种生产许可证记录情况，用药情况等。