面对禽流感疫情来势汹汹，台湾当局和暴发疫情的县市政府展开防疫大战，除全面实施禁止宰杀活禽4天外，还调拨大量经费和物资，对暴发疫情养殖场进行后续扑杀及全面消毒，目前已扑杀家禽总数逼近百万大关。
据当局“农业委员会”动植物防疫检疫局25日披露，截至24日18时，共有11个县市的485处养殖场送检，确诊445处养殖场有H5亚型禽流感，由县市动物防疫机关执行后续扑杀及全场清洁消毒，目前共完成310处养殖场扑杀，共计家禽936033只。
为防堵禽流感疫情发生及传播，岛内所有家禽屠宰场自24日中午12时实施为期4天的休宰，其间家禽禁止移动，防检局各分局及财团法人“中央畜产会”屠检兽医师到各肉品市场、屠宰场及化制场监督全面消毒作业，防检局也会同检察、调查机关加强违法私宰查缉。
继23日拨付约1.37亿元新台币的扑杀、防疫经费后，台“农委会”24日又补足这些县市所需的防护衣、N95口罩和平面口罩等防疫物资。