近年来，福建检验检疫局紧紧围绕“提高产品质量”中心目标，经过长期的探索与实践，以推行农业合作组织为突破口，落实企业质量主体责任，以风险管理为基础，强化检验检疫监管责任，探索出一条出口烤鳗检验检疫监管新模式。2008年辖区烤鳗出口不合格率、被国外通报批次比上年下降38.5%和86.1%，其中2007年9月开始连续19个月未被日方检出不合格。今年1-6月，在全球发生金融危机的不利局面下，辖区出口烤鳗仍达8549吨、9900万美元，同比增长24.17%和9.56%。主要做法如下：
一、落实企业主体责任，建立以农业合作组织为基础的生产全过程质量自控体系
通过农业合作组织自我管理和自我规范，提高了源头管理水平，减轻了检验检疫部门的监管压力，有效提高了鳗鱼原料的安全水平。截止目前，福建局已在185家备案养殖场建立和运行GAP体系；170多家备案养鳗场实施良好药品经营管理规范，实行集中供药，未发生一起用药安全事故。2008年，福建局辖区鳗鱼产品送检药残不合格率已降至5‰以下，硝基呋喃、孔雀石绿等曾经高检出的禁用药更是降至1‰以下。“公司+农业合作组织+基地+标准化”的出口鳗鱼产品管理模式正在福建扎根和发展，国家质检总局领导对该模式给予了充分肯定。
一是组建农业合作组织。从规范农业化学品供应入手，引导养殖散户成立农业合作组织，由农业合作组织对基地实施“五统一”，即统一管理、统一防治、统一选药购药、统一供药、统一监控。农业合作组织现有三种模式：一是长乐模式，即由养鳗场自愿入股鳗协服务中心，建立经济利益共同体联合经营；二是三明模式，即通过鳗鱼协会牵头组织养鳗场形成；三是福清模式，即由政府主导形成。
二是建立药残控制示范区。在鳗鱼主产地福建长乐，依托鳗农合作组织建立“出口鳗鱼药残控制示范区”，在示范区大力推行良好药品经营质量管理规范(GSP)、良好农业规范(GAP)、HACCP等质量安全控制体系，对示范区鳗鱼生产链实施全过程科学、严密和可追溯的控制，杜绝禁用药物污染。2004年以来长乐聚泉公司连续五年保持烤鳗出口创汇居全国第一。“长乐出口鳗鱼安全卫生控制模式”得到广大出口食品企业的认可和推崇，得到国家质检总局领导的充分肯定。
三是建立身份追溯系统。在福建三明，依托农业合作组织推行良好农业规范(GAP)，在此基础上探索建立“出口食品农产品质量安全身份追溯系统”，将企业对原料和加工生产的全过程GAP、HACCP、GSP控制信息通过互联网供消费者、采购商和进出口国官方查询，实现出口食品农产品“透明化”生产，有效提升消费者对企业产品的消费信心，有效增强官方、采购商对相关企业安全卫生控制的信任度。
二、落实检验检疫监管责任，建立以风险分析为基础的出口鳗鱼产品检验检疫监管体系
在对鳗鱼产品质量监管中，强化检验检疫监管责任，凝聚兄弟直属局监管合力，形成了严密的检验检疫监管链条。
一是建立风险评估制度。每季度定期汇总实验室检测数据，分析检测项目不合格率趋势，针对重要风险及时预警，做到安全隐患早发现、早应对、早消除；应用风险评估原理，依据对源头用药调查、生产加工、检测数据、进口国要求的综合分析，研判原料、辅料、加工等环节存在的潜在危害及危害发生可能性大小，从而确定重点检测项目和监测项目。
二是建立信用管理制度。2005年在系统内率先出台了信用等级评定工作规范，建立出口企业信用数据库。目前26家烤鳗企业已全部纳入信用管理，作为分类管理的重要依据之一。
三是建立分类管理制度。早在2003年就出台了《出口烤鳗企业分类管理办法》，每年通过对烤鳗企业诚信意识、管理水平、产品质量状况等方面综合评估，确定出口烤鳗企业检验检疫监管分类等级，并实施不同的检验检疫监管方案。目前有6家企业为一类企业，12家企业为二类企业，4家企业为三类企业，4家企业为四类企业。
四是探索建立有效的口岸检验检疫逃漏检核查体系。通过调研，对货物装载清单、提单等单证与出口报检产品进行比对，核查企业报检产品和目的地的真实性，有效防止企业擅自更改出口目的地，将未经检验检疫合格的食品拦截在出口环节。
五是加强对外协作增强出口把关合力。分别与江苏、江西、厦门等直属局签署了《江苏局与福建局关于对出口烤鳗企业对应养鳗场共同监管的职责分工备忘录》、《江西局与福建局出口水产品检验检疫监管合作协议》、《厦门局与福建局关于促进水产品出口检验检疫监管协作备忘录》等合作协议，规范了异地鳗鱼原料供货的检验检疫监管工作。同时，强化条块协作，与省外经贸厅联合开展企业质量安全管理培训，与省海洋与渔业局建立紧密联系工作机制。